数据集来源:GEO GSE255933 | Nature Communications (2026) | PMID: 39958474
研究背景:恩格列净(Empagliflozin, EMPA)是一种SGLT2抑制剂,已被发现具有心脏保护作用。该研究通过单细胞RNA测序,系统解析了恩格列净在小鼠心肌缺血再灌注(I/R)损伤中的细胞类型特异性转录组变化。
实验设计:38个RNA样本,三种心脏细胞类型 × 三组处理:
- Cardiomyocytes(心肌细胞):Sham n=4 | Control IR n=5 | EMPA IR n=4
- Endothelial Cells(内皮细胞):Sham n=4 | Control IR n=4 | EMPA IR n=5
- Sorted Fibroblasts(成纤维细胞):Sham n=4 | Control IR n=4 | EMPA IR n=4
分析方法:Welch’s t-test(非等方差),原始 p<0.05 且 |log2FC| > 1 筛选差异基因。基因symbol通过Ensembl GRCm39 (v106) 批量注释。
一、心肌细胞(Cardiomyocytes)
| 比较 | 上调 | 下调 | 总计 | 下载链接 |
|---|---|---|---|---|
| Control IR vs Sham I/R 损伤效应 |
71 | 79 | 150 | Cardiomyocytes_IR_effect_DEGs.csv |
| EMPA IR vs Control IR 恩格列净心脏保护 |
10 | 1,242 | 1,252 | Cardiomyocytes_EMPA_protective_DEGs.csv |
| EMPA IR vs Sham 总体EMPA效应 |
17 | 1,607 | 1,624 | Cardiomyocytes_EMPA_vs_Sham_DEGs.csv |
Top DEGs(恩格列净保护,Cardiomyocytes EMPA IR vs Control IR)
| Gene Symbol | Ensembl ID | mean EMPA IR | mean Control IR | log2FC | p-value |
|---|---|---|---|---|---|
| ENSMUSG00000037112 | ENSMUSG00000037112 | 2.50 | 21.60 | -2.69 | 2.31e-05 |
| ENSMUSG00000074925 | ENSMUSG00000074925 | 9.25 | 29.40 | -1.57 | 4.39e-05 |
| ENSMUSG00000040483 | ENSMUSG00000040483 | 13.50 | 39.06 | -1.47 | 5.46e-05 |
| ENSMUSG00000040836 | ENSMUSG00000040836 | 5.50 | 23.38 | -2.06 | 7.00e-05 |
| ENSMUSG00000054280 | ENSMUSG00000054280 | 5.25 | 27.00 | -2.35 | 7.25e-05 |
二、内皮细胞(Endothelial Cells)
| 比较 | 上调 | 下调 | 总计 | 下载链接 |
|---|---|---|---|---|
| Control IR vs Sham I/R 损伤效应 |
231 | 211 | 442 | Endothelial_Cells_IR_effect_DEGs.csv |
| EMPA IR vs Control IR 恩格列净保护 |
76 | 110 | 186 | Endothelial_Cells_EMPA_protective_DEGs.csv |
| EMPA IR vs Sham 总体EMPA效应 |
246 | 138 | 384 | Endothelial_Cells_EMPA_vs_Sham_DEGs.csv |
三、成纤维细胞(Sorted Fibroblasts)
| 比较 | 上调 | 下调 | 总计 | 下载链接 |
|---|---|---|---|---|
| Control IR vs Sham I/R 损伤效应 |
247 | 248 | 495 | Sorted_Fibroblasts_IR_effect_DEGs.csv |
| EMPA IR vs Control IR 恩格列净保护 |
27 | 116 | 143 | Sorted_Fibroblasts_EMPA_protective_DEGs.csv |
| EMPA IR vs Sham 总体EMPA效应 |
140 | 760 | 900 | Sorted_Fibroblasts_EMPA_vs_Sham_DEGs.csv |
分析注释:本分析采用Welch’s t-test(非配对、等方差非齐),筛选标准为 p<0.05 且 |log2FC| > 1。原始 p 值未做多重检验校正(BH),样本量较小(n=4-5)时校正后功效较低,结果仅供参考。基因symbol通过Ensembl GRCm39 (v106) 批量注释。部分基因symbol未匹配,保留Ensembl ID原始形式。
参考分析:GSE298751 差异基因分析 · GSE264207 差异基因分析
关键词:GSE255933, Empagliflozin, SGLTT2 inhibitor, myocardial ischemia-reperfusion injury, single-cell RNA-seq, cardiomyocytes, endothelial cells, fibroblasts, cardioprotection, mouse