GSE255933 | 恩格列净在急性心肌梗死中的心脏保护:三种心脏细胞类型的差异表达分析

数据集来源:GEO GSE255933 | Nature Communications (2026) | PMID: 39958474

研究背景:恩格列净(Empagliflozin, EMPA)是一种SGLT2抑制剂,已被发现具有心脏保护作用。该研究通过单细胞RNA测序,系统解析了恩格列净在小鼠心肌缺血再灌注(I/R)损伤中的细胞类型特异性转录组变化。

实验设计:38个RNA样本,三种心脏细胞类型 × 三组处理:

  • Cardiomyocytes(心肌细胞):Sham n=4 | Control IR n=5 | EMPA IR n=4
  • Endothelial Cells(内皮细胞):Sham n=4 | Control IR n=4 | EMPA IR n=5
  • Sorted Fibroblasts(成纤维细胞):Sham n=4 | Control IR n=4 | EMPA IR n=4

分析方法:Welch’s t-test(非等方差),原始 p<0.05 且 |log2FC| > 1 筛选差异基因。基因symbol通过Ensembl GRCm39 (v106) 批量注释。


一、心肌细胞(Cardiomyocytes)

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Control IR vs Sham
I/R 损伤效应
71 79 150 Cardiomyocytes_IR_effect_DEGs.csv
EMPA IR vs Control IR
恩格列净心脏保护
10 1,242 1,252 Cardiomyocytes_EMPA_protective_DEGs.csv
EMPA IR vs Sham
总体EMPA效应
17 1,607 1,624 Cardiomyocytes_EMPA_vs_Sham_DEGs.csv

Top DEGs(恩格列净保护,Cardiomyocytes EMPA IR vs Control IR)

Gene Symbol Ensembl ID mean EMPA IR mean Control IR log2FC p-value
ENSMUSG00000037112 ENSMUSG00000037112 2.50 21.60 -2.69 2.31e-05
ENSMUSG00000074925 ENSMUSG00000074925 9.25 29.40 -1.57 4.39e-05
ENSMUSG00000040483 ENSMUSG00000040483 13.50 39.06 -1.47 5.46e-05
ENSMUSG00000040836 ENSMUSG00000040836 5.50 23.38 -2.06 7.00e-05
ENSMUSG00000054280 ENSMUSG00000054280 5.25 27.00 -2.35 7.25e-05

二、内皮细胞(Endothelial Cells)

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Control IR vs Sham
I/R 损伤效应
231 211 442 Endothelial_Cells_IR_effect_DEGs.csv
EMPA IR vs Control IR
恩格列净保护
76 110 186 Endothelial_Cells_EMPA_protective_DEGs.csv
EMPA IR vs Sham
总体EMPA效应
246 138 384 Endothelial_Cells_EMPA_vs_Sham_DEGs.csv

三、成纤维细胞(Sorted Fibroblasts)

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Control IR vs Sham
I/R 损伤效应
247 248 495 Sorted_Fibroblasts_IR_effect_DEGs.csv
EMPA IR vs Control IR
恩格列净保护
27 116 143 Sorted_Fibroblasts_EMPA_protective_DEGs.csv
EMPA IR vs Sham
总体EMPA效应
140 760 900 Sorted_Fibroblasts_EMPA_vs_Sham_DEGs.csv

分析注释:本分析采用Welch’s t-test(非配对、等方差非齐),筛选标准为 p<0.05 且 |log2FC| > 1。原始 p 值未做多重检验校正(BH),样本量较小(n=4-5)时校正后功效较低,结果仅供参考。基因symbol通过Ensembl GRCm39 (v106) 批量注释。部分基因symbol未匹配,保留Ensembl ID原始形式。

参考分析:GSE298751 差异基因分析 · GSE264207 差异基因分析

关键词:GSE255933, Empagliflozin, SGLTT2 inhibitor, myocardial ischemia-reperfusion injury, single-cell RNA-seq, cardiomyocytes, endothelial cells, fibroblasts, cardioprotection, mouse

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